Seit ihrem Eintritt in die SPD 1985 ist Marlies Stotz bis zum Jahr 2000 als Abgeordnetenmitarbeiterin im Landtag NRW sowie im Deutschen Bundestag tätig gewesen.

Seit 1989 ist sie Mitglied im Rat der Stadt Lippstadt und war von 1994 – 2002 stellvertretende Bürgermeisterin.

Von 1992 – 2000 war sie Mitglied im Vorstand der SPD Lippstadt, deren Vorsitz sie seit 2000 innehat.

Die Interessen der Bürger vertritt sie seit 2000 als Mitglied im Landtag von Nordrhein-Westfalen. Sie ist Mitglied im Ausschuss für Schule und Weiterbildung und stellv. Ausschussvorsitzende im Ausschuss für Kinder, Jugend und Familie.

Darüber hinaus ist sie seit 2001 Mitglied im Landesvorstand und im Präsidium der NRWSPD.